Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dctn1O08788 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dctn1O08788 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dctn1O08788 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms