Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp12O08736 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Casp12O08736 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp12O08736 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp12O08736 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp12O08736 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms