Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm3488M0QW81 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm3488M0QW81 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms