Protein–RNA interactions for Protein: L7N285

Gm3115, Predicted gene 3115, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3115L7N285 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm3115L7N285 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm3115L7N285 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms