Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20939L7N243 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20939L7N243 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms