Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2al1oL7MU04 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2al1oL7MU04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms