Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm19585-201ENSMUST00000186007 587 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm42462-201ENSMUST00000196543 1363 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gm21887J3QQ04 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms