Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2056J3QQ02 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2056J3QQ02 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms