Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm5849J3QPE5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm5849J3QPE5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms