Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm8356J3QPD3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm8356J3QPD3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms