Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC1

Gm933, Predicted gene 933, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm933J3QPC1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm933J3QPC1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm933J3QPC1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm933J3QPC1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm933J3QPC1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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