Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm21900J3QP38 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Gm21900J3QP38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm21900J3QP38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm21900J3QP38 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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