Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim18J3QNP2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim18J3QNP2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms