Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm21976J3QNN2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm21976J3QNN2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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