Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Gm17577J3QNF7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm17577J3QNF7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Gm17577J3QNF7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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