Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20918J3QN17 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm20918J3QN17 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms