Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm20825J3QM67 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20825J3QM67 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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Gm20825J3QM67 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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Gm20825J3QM67 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm20825J3QM67 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Gm20825J3QM67 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm20825J3QM67 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20825J3QM67 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm20825J3QM67 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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