Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm29394H3BIW7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms