Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Taf4bG5E8Z2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Taf4bG5E8Z2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
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