Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pcf11G3X9Z4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcf11G3X9Z4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pcf11G3X9Z4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms