Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sh3tc1G3X9F6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sh3tc1G3X9F6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms