Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
2610008E11RikG3X964 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
2610008E11RikG3X964 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms