Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vmn1r167G3UW71 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vmn1r167G3UW71 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms