Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Ercc6F8VPZ5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ercc6F8VPZ5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ercc6F8VPZ5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ercc6F8VPZ5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms