Protein–RNA interactions for Protein: F7BCK0

Dcdc2b, Doublecortin domain-containing 2b (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2bF7BCK0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dcdc2bF7BCK0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dcdc2bF7BCK0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms