Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Gm20538F6Z9R1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Gm20538F6Z9R1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms