Protein–RNA interactions for Protein: F6R3P9

Prl3d2, Growth hormone d5, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3d2F6R3P9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Prl3d2F6R3P9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prl3d2F6R3P9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms