Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp31E9Q6Y8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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Usp31E9Q6Y8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp31E9Q6Y8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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