Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BC005561E9Q5E2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
BC005561E9Q5E2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BC005561E9Q5E2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms