Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Susd1E9Q3H4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Susd1E9Q3H4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms