Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Zfp558E9Q1J0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Zfp558E9Q1J0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Zfp558E9Q1J0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Zfp558E9Q1J0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Zfp558E9Q1J0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Zfp558E9Q1J0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Zfp558E9Q1J0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Zfp558E9Q1J0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Zfp558E9Q1J0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Zfp558E9Q1J0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Zfp558E9Q1J0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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