Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
2610021A01RikE9Q0Q3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms