Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sptbn4E9PX29 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sptbn4E9PX29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sptbn4E9PX29 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms