Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccdc62E9PVD1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc62E9PVD1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms