Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc175E9PVB3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms