Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clca3bE9PUL3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Clca3bE9PUL3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clca3bE9PUL3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clca3bE9PUL3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms