Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Piezo1E2JF22 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Piezo1E2JF22 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Piezo1E2JF22 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms