Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Klhl3E0CZ16 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms