Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20521D3Z5F7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20521D3Z5F7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20521D3Z5F7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20521D3Z5F7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20521D3Z5F7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20521D3Z5F7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gm20521D3Z5F7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Gm20521D3Z5F7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gm20521D3Z5F7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms