Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm1330D3Z460 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm1330D3Z460 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms