Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc6D3YZP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc6D3YZP9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc6D3YZP9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms