Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Kif28pD3YXS5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Kif28pD3YXS5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms