Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd1D3YXK1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.9 ms