Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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BC048679D3YXE9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
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BC048679D3YXE9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BC048679D3YXE9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BC048679D3YXE9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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BC048679D3YXE9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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