Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm4950D3YUM8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm4950D3YUM8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm4950D3YUM8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm4950D3YUM8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm4950D3YUM8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm4950D3YUM8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm4950D3YUM8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms