Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms