Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptprz1B9EKR1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ptprz1B9EKR1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ptprz1B9EKR1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms