Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms