Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Clip3B9EHT4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clip3B9EHT4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms