Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm6133B2RY53 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm6133B2RY53 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm6133B2RY53 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms